Hai câu thơ đầu khẳng định núi sông nước Nam là chủ quyền thiêng liêng của Đại Việt, là nơi "vua Nam ở", đã được ghi rõ ở sách Trời:
"Núi sông Nam Việt vua Nam ở
Vằng vặc sách trời chia xứ sở".
Hai câu thơ 3, 4 thể hiện lòng căm thù hành động xâm lược phi nghĩa đầy tội ác của giặc Tống, cảnh cáo quân giặc nhất định sẽ bị nhân dân ta đánh bại. Nhà thơ đã nêu cao lòng yêu nước và sức mạnh Đại Việt quyết tâm chiến đấu bảo vệ sông núi nước Nam của dân tộc ta:
"Giặc dữ cớ sao phạm đến đây
Chúng mày nhất định phải tan vỡ".
Tóm lại, bài thơ của Lý Thường Kiệt đã khẳng định chủ quyền của đất nước ta, nêu cao quyết tâm của nhân dân ta đánh thắng quân xâm lược để bảo vệ Tổ quốc thân yêu. Do đó bài thơ "Sông núi nước Nam’’ mang ý nghĩa lịch sử trọng đại như Bản Tuyên ngôn độc lập lần thứ nhất của Đại Việt.